工業及生活用水的消毒方法主要有：氯消毒、臭氧消毒、次氯酸鈉消毒、二氧化氯消毒、氯胺消毒等。
　 1、 氯消毒優點是經濟有效，使用方便。缺點是受污染水經氯消毒后往往產生一些有害健康的副產物，例如三氯甲烷。
　 2、 臭氧消毒優點：不會產生三鹵甲烷等副產物，其殺菌和氧化能力均比氯強。缺點是：設備的初始投資費用比較高。
3、次氯酸鈉消毒優點是：用海水或濃鹽水作為原料，產生次氯酸鈉，可以現場配置，就地投加，適用方便，投量容易控制。缺點是需要有次氯酸鈉發生器與投加設備。
4、二氧化氯消毒，ClO2對細菌、病毒等有很強的滅活能力。ClO2的*大優點是不會與水中有機物作用生成三氯甲烷。ClO2消毒還有以下優點：消毒能力比氯強，故在相同條件下，投加量比cl2少；ClO2余量能在管網中保持很長時間。消毒效果受水的ph值影響極小。作為氧化劑，ClO2能有效地去除或降低水的色、嗅及鐵、錳、酚等物質。它與酚起氧化反應，不會生成氯酚。缺點是：ClO2本身和ClO2－對人體紅細胞有損壞，有報導認為，還對人的神經系統及生殖系統有損害。
　　5、氯胺消毒的優點是：當水中含有有機物和酚時，氯胺消毒不會產生氯臭和氯酚臭，同時大大減少THMs產生的可能；能保持水中余氯較久，適用與供水管網較長的情況。缺點是：殺菌力弱。